太初元年五月，关内外两支齐军合兵一处，追击清、朝残兵与哥萨克骑兵。
五月初五日，齐军攻占赫图阿拉，俘虏建州女真一万余人，包衣两万人，其中青壮五千人被遣送辽南挖矿,其余皆被处死。
五月十二日，大军围攻宽甸，截断了朝鲜兵回国的退路，李舜义和最后八千朝鲜兵无路可走，被蒲刚逼迫投江，朝鲜兵淹死大半,剩余的两千人被俘后成为矿工。
五月三十日，辽东全境光复。
自此，辽东辽西重新归于大齐统治之下,历时一年的辽沈战役终于结束。
六月间，武定皇帝照搬山东模式，对辽东各地富户、缙绅以及曾经资助满清的所有人，进行了一场彻底的清洗运动，在这场血腥屠戮中，共有十二万人被屠戮、驱逐流放，其中大部分为无罪的富人。
七月初，齐军各个方向的军事行动暂时停止，武定皇帝养精蓄锐，准备秋后对库页岛、朝鲜发动远征。
至太初元年七月，帝国疆域囊括山东、辽东、辽西、河南东部。
相比一年前，大齐疆土缩水了一大半不止，不过，由于皇帝坚决执行屠杀与大清洗,他的统治，比之从前要更为牢固。
依靠军队、商会、农会、特务这四大支柱，穿越者第一次在这片土地上,建立起了一个深入县城,乡村，甚至每个家庭的极权统治体系。
在他的统治下，所有人都被绑架在这架战车上，所有人都受到严密监视，所有人都失去自由（言论出版结社）
如同后世苏维埃的严酷统治一样，绝大多数富人、中上层、读书人的自由被剥夺，齐国施行多数人（底层平民）对少数人的暴政。
这，就是帝国的代价。
帝国子民失去的只是自由，那些被帝国打败的敌人，失去的则是全部。
总数超过四万俘虏被送往各地矿场，开启他们的赎罪之旅，主要包括幸存的建州八旗，朝鲜王军、五百二十名东印度公司水手，以及一支千人规模的哥萨克雇佣军。
由于辽南被齐军占领，进入辽东的五百多东印度公司职员无路可逃，他们很多人跟随清军一起退守宁古塔，最终都被齐军俘获。
对于这些人的处理,武定皇帝表现的非常仁慈，只是将其发配到各地矿场服役。
只对东印度公司头领科伦进行了无害化处理也就是凌迟处死。
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